شماره ركورد
14245
شماره راهنما(اين فيلد مربوط به كارشناس ميباشد لطفا آن را خالي بگذاريد)
14245
پديد آورنده
آرش رفيعي
عنوان
ارائهي روشي براي تحليل مسيرهاي زيستي با استفاده از مدلهاي گرافيكي
مقطع تحصيلي
كارشناسي ارشد
رشته تحصيلي
هوش مصنوعي و رباتيك
سال تحصيل
ارديبهشت ماه 1394
تاريخ دفاع
ارديبهشت ماه 1394
استاد راهنما
دكتر عادل رحماني
دانشكده
كامپيوتر
چكيده
چكيده
در زيست¬شناسي مولكولي به ژن¬هايي كه با يكديگر در تعامل هستند و يك فرآيند زيستي خاصي را به سرانجام مي¬رسانند "مجموعه ژن"، و اگر ارتباط بين اين ژن¬ها نيز مشخص باشد به آن¬ها "مسير زيستي"ميگويند. در شرايط معمولي ميزان بيان اين ژن¬ها عادي است، اما شرايطي پيش خواهد آمد كه ميزان بيان برخي از ژن¬ها به شدت افزايش يا كاهش مي¬يابد كه در اين حالت به آن¬ها "ژن¬هاي متفاوت بيان"مي¬گويند.
از طريق انجام مطالعاتي كه به مقايسه كلاس¬هاي مختلف بيان ژن مي¬پردازند، مي¬توان صد¬ها يا هزاران ژن متفاوت بيان را بين نمونه گروه¬ها مشخص كرد. بررسي و تحليل دقيق نتايج اين آزمايش¬ها مي¬تواند به ارتقاء دانش و بينش زيستي منجر شود. به عنوان مثال، بوسيله مشخص كردن مسيرهاي سيگنالي نهفته در تغييرات مشاهده شده، مي¬توان به درك بهتري از مكانيزم بيماري دست پيدا كرد.كليد اصلي تبديل حجم عظيمي از داده¬هاي حجيم مولكولي فعلي به دانش زيستي در تفسير نتايج اين آزمايش¬ها نهفته است، كه از اين طريق مي¬توان به پديده زيستي كه در بطن اين داده¬ها نهفته است، دست پيدا كرد.تمركز بيشتر روش¬هاي فعلي تجزيه و تحليل مسير، يا بر روي تعداد ژن¬هاي متفاوت بيان مشاهده شده در مسير مورد نظر، و يا بر روي ارتباط بين ژن¬هاي مسير و ژن¬هاي نمونه¬ها است.هر دو روش ، مسيرهاي زيستي را به صورت يك ليست ساده از ژن¬ها در نظر گرفته، و تعاملات پيچيده بين ژن¬هاي مسير را ناديده مي-گيرند، در حاليكه هدف اصلي از ايجاد مسيرهاي زيستي توصيف همين ارتباطات پيچيده بوده است.
در اين پايان¬نامه به تشريح روش نويني پرداخته شده است كه مشكلات روش¬هاي پيشين را نداشته و ساختار مسير و ارتباط بين ژن¬ها را نيز در نظر مي¬گيرد. اين روش در مدل¬سازي خود از تئوري¬هاي گراف و شبكه¬هاي بيزي استفاده مي¬كند.شبكه¬هاي بيزي در مقابل نويز مقاومت خوبي دارند و بر روي تعاملات محلي متمركز مي¬شوند. لذا اين روش نيز در مقابل نويز مقاوم بوده و از دقت بالايي برخوردار خواهد بود. اين امر در آزمايشهاي انجام شده بر روي داده¬هاي مصنوعي (با دقت تقريبي 83%) به خوبي نشان داده شده است.
واژههاي كليدي:تجزيه و تحليل مسير، شبكه بيزي، گراف، بيان ژن، داده¬هاي حجيم مولكولي، دانش زيستي