17308

17308

تاثير اندركنش پليمر و ديواره نانو حفره بر تابع توزيع زمان عبور پليمر

كارشناسي ارشد

اتمي و مولكولي

اسفند 1395

دكتر روح الله عبدالوهاب

فيزيك

پديده عبور پليمر از نانوحفره يكي از مهمترين فرآيند هاي زيستي مي باشد. در اين فرآيند پليمر از ناحيه اي به ناحيه ديگر مي رود. در اين رساله به بررسي اثر برهمكنش نانوحفره و پليمر بر تابع توزيع زمان عبور پرداخته شده است. بدينگونه كه در دوحالت پليمر تعادلي و غير تعادلي, دو بازه نيروي ضعيف و متوسط و سه اندازه دهانه نانوحفره گوناگون, متوسط زمان عبور مورد بررسي قرار گرفته است. براي حالت غيرتعادلي مشاهده گرديد با افزايش عمق چاه پتانسيل لنارد-جونز و يا افزايش اندازه دهانه نانوحفره, زمان متوسط عبور پليمر افزايش مي يابد. براي تابع توزيع زمان نيز با افزايش عمق چاه پتانسيل (انرژي), تابع توزيع مربوطه عريض تر و همچنين به سمت زمانهاي بيشتر سوق پيدا مي كند. براي حالت پليمر در حال تعادل, با افزايش عمق چاه پتانسيل, لزوما همانند حالت پليمر غير تعادلي, ميانگين زمان عبور كاملا افزايشي نمي باشد و بستگي به اندازه دهانه نانوحفره و نيروي اعمالي دارد. همچنين براي تابع توزيع زمان نيز با افزايش دهانه و يا عمق چاه پتانسيل, تنها در بازه نيروي ضعيف رفتاري مشابه حالت غير تعادلي يعني سوق به سمت زمان هاي بيشتر و عريض تر شدن تابع توزيع در عمق چاه پتانسيل بزرگتر را مي توان مشاهده كرد و در بازه نيروي متوسط اين نتيجه گيري برقرار نمي باشد.

1396/02/21

1/1/1900 12:00:00 AM

We investigate the dynamics of driven polymer translocation through nanopore by 2D molecular dynamics simulation (Langevin), focusing on the interaction between polymer and nanopore and its effect on time distribution function of polymer translocation. For unrelaxed polymer, under two different forces, we demonstrate that mean translocation time is increased by growth of depth of Lennard-Jones potential well (energy) and/or increasing pore width, furthermore, we find time distribution function of polymer is got wider for higher depth of Lennard-Jones potential well. In contrast, for relaxed polymer, increasement of mean time translocation via higher depth of Lennard-Jones potential well (energy) or increasing of pore width is not seen generally.