11821

بررسي روش‌هاي به كار گرفته شده در آناليز فلاكس‌هاي متابوليكي

1398

فرشته نعيم‌پور

مهندسي متابوليك ابزار دستكاري هدفمند مسيرهاي متابوليكي به منظور ايجاد تغييرات مطلوب در ميكروارگانيسم¬ها مطابق تعريف بيلي (1991) مي¬باشد. با انجام مطالعات دقيق بر روي متابوليسم، شبكه واكنش¬هاي متابوليك ميكروارگانيسم¬هاي مختلف در مقياس ژنوم با در نظر گرفتن جزئيات بيوشيميائي شناسايي و تعريف شده¬اند. شبكه¬هاي متابوليكي اغلب بزرگ و پيچيده اند به همين جهت از الگوريتم¬هاي محاسباتي مانند آناليز موازنه فلاكس متابوليكي و آناليز مسيرهاي متابوليكي براي ايجاد ارتباط بين ژنوتيپ و فنوتيپ ميكروارگانيسم و همچنين پيش¬بيني نتايج و تحليل آن¬ها استفاده مي¬شود. شبيه¬سازي متابوليسم سلولي در قالب رياضي و پيش¬بيني نتايج دستكاري با استفاده از ابزارهاي محاسباتي سبب كاهش تعداد آزمايش¬هاي تجربي و صرفه¬جويي در زمان مي¬شود؛ بنابراين در اين مطالعه الگوريتم¬هاي محاسباتي متداول و پركاربرد و الگوريتم¬هاي محاسباتي نوين از نظر روش و جزئيات بررسي مي¬شوند.

9/29/2020 12:00:00 AM

78008

1401/12/08

Investigating the methods used in the analysis of metabolic fluxes

آناليز موازنه فلاكس , الگوريتم‌هاي محاسباتي , مهندسي متابوليك , جوامع ميكروبي

Flux balance analysis , Computational algorithms , Metabolic Engineering , Microbial communities